Archer scopre che gli
Xindi sono stati manipolati da una cospirazione per distruggere la
Terra che avviene 400 anni nel futuro (
Azati Prime).

Vengono integrate nell'
Enterprise alcune tecnologie aliene che ne migliorano i sistemi, inclusa la propulsione (
E2).
Archer presenta le prove della cospirazione al consiglio degli
Xindi: gli umanoidi e gli arborei vogliono proseguire la discussione, mentre i rettili e gli insettoidi non considerano nemmeno la possibilità di una cospirazione; gli acquatici hanno bisogno di tempo per prendere una decisione. I costruttori delle sfere, resisi conto della situazione, convincono gli insettoidi e i rettili ad agire in maniera indipendente e a portare a termine il piano contro la
Terra (
The Council).

Il consiglio degli
Xindi è diviso e gli acquatici prendono la stessa posizione degli umanoidi e degli arborei, ma l'ordigno costruito dagli
Xindi viene armato e inviato contro la
Terra. Sull'
Enterprise prende corpo un piano per distruggere la sfera 41, creando una reazione a catena che annienterebbe gli effetti della
Distesa Delfica (
Countdown).